卧龙自然保护区位于四川省阿坝藏族羌族自治州汶川县西南部，邛崃山脉东南坡，距四川省会成都130公里，交通便利。保护区始建于1963年，面积20万公顷，是中国最早建立的综合性国家级保护区之一，是国家和四川省命名的“科普教育基地”、“爱国主义教育基地”。保护区现有人口5343人，其中，农业人口4550人。
1980年，保护区加入联合国教科文组织“人与生物圈”保护区网，并与世界野生生物基金会合作建立中国保护大熊猫研究中心。1983年3月经国务院批准，将卧龙保护区内汶川县的卧龙、耿达两个公社划定为汶川县卧龙特别行政区，实行部、省双重领导体制，由林业厅代管。同年7月，省政府、原林业部联合作出了将四川省汶川县卧龙特别行政区改为四川省汶川卧龙特别行政区的决定，与卧龙自然保护区管理局合署办公的综合管理体制。
国家级第三大自然保护区。四川省面积最大、自然条件最复杂、珍稀动植物最多的自然保护区。保护区横跨卧龙、耿达两乡，东西长52公里、南北宽62公里，总面积约70万公顷。主要保护西南高山林区自然生态系统及大熊猫等珍稀动物。1980年加入联合国国际生物圈保护区网，是中国第一个自然保护资源特别行政区。
四川卧龙国家级自然保护区，创建于1963年，当时面积2万公顷，1975年，面积扩大到20万公顷，是我国建立最早、栖息地面积最大、以保护大熊猫及高山森林生态系统为主的综合性自然保护区，是2006年7月世界遗产大会批准列入世界自然遗产名录的“卧龙·四姑娘山·夹金山脉”四川大熊猫栖息地最重要的核心保护区。卧龙自然保护区以“熊猫之乡”、“宝贵的生物基因库”、“天然动植物园”享誉中外。
中国政府在世界野生生物基金会（WWF）援助下建立的13个大熊猫自然保护区中，卧龙自然保护区是世界上最为著名的一个。1978年，保护区建立了世界上第一个大熊猫野外生态观察站，中外科学家采用无线电跟踪等手段，对大熊猫个体生态、种群以及大熊猫主食竹类进行研究，取得了可喜的成果。1983年加入国际“人与生物圈计划”。主要保护对象是大熊猫等珍稀动物及森林生态系统。1980年与世界野生动物基金会合作在卧龙建立中国保护大熊猫研究中心。
卧龙自然保护区地理条件独特、地貌类型复杂，风景秀丽、景观多样、气候宜人，集山、水、林、洞、险、峻、奇、秀于一体，还有浓郁的藏、羌民族文化。区内建有相当规模的大熊猫、小熊猫、金丝猴等国家保护动物繁殖场；有世界著名的“五一棚”大熊猫野外观测站；有国内迄今为止以单一生物物种为主建立的博物馆的大熊猫博物馆。
多年来，卧龙自然保护区着眼于建设一流的国家自然保护区目标，坚持保护和合理利用的方针，积极开展保护、科研、社区建设等工作，使大熊猫为主的野生动植物资源和高山生态系统得到有效保护。中国保护大熊猫研究中心自成立以来，通过不懈的努力，成功攻克了圈养大熊猫人工繁育工作中的“发情难、配种受孕难、幼仔成活难”的三大难关，人工繁殖大熊猫48胎、72仔、成活59仔，幼仔存活率已经连续5年达到100%。圈养大熊猫总数达到80余只，占世界圈养种群的60%。同时也培养、锻炼出了一支世界上最具活力的大熊猫科研队伍。已出版学术专著8部，发表科研论文200多篇，有4项获部、省科技成果奖，有5人次获优秀科技论文奖。并在全世界范围内开展了大熊猫认养活动，保护区积极寻求对外合作，建立合作开发机制。目前，区内经济得到有效发展，人民生活水平显著提高，2004年全区人均收入达2074.39 元,比2003年增加234.21元。基础设施建设发生根本性改善，保护区的建设和发展向符合中国国情的良性循环方向发展。